S.T.A.L.K.E.R.: Clear Sky - это приквел Shadows of Chernobyl, ролевого экшена, рассказывающий об альтернативной реальности и о чернобыльской Зоне Отчуждения, в которой начали появляться аномалии и артефакты. События игры разворачиваются за год до событий оригинальной игры, и Зона в приквеле показана гораздо более агрессивной, чем в оригинале. Главным героем игры является наемник по прозвищу Шрам, цель которого - остановить серию чрезвычайно мощных выбросов из четвертого энергоблока, которыми Зона реагирует на вторжение в самое свое сердце. Шраму предстоит пробиться через полчища мутантов и бандитов, дабы прорваться в центр Зоны и самолично уничтожить сталкера, который вызвал все эти аномалии.
По сравнению с "Тенями Чернобыля" "Чистое Небо" несколько меньше - разработчики убрали ряд локаций, добавив несколько новых, куда меньше размером. Вернулись изначально отсутствующие, но обещанные изначально локации Рыжий Лес и Лиманск, вернулся сбор артефактов с помощью особых детекторов, без которых артефакт невозможно увидеть невооруженным глазом. Так же разработчики добавили в игру возможность модернизации и починки вооружения, что позволяет игрокам модифицировать и улучшать стволы "под себя".