Спустя столетие после событий первой части игры две могущественные корпорации вновь ступают на поверхность Марса. На этот раз их цель — заполучить контроль над ценнейшим ресурсом планеты — протонием. Началась ожесточённая борьба за господство, исход которой решит судьбу Марса.