В игре Alcatraz группа вооруженных до зубов террористов заняла остров Алькатраз, превратив его из тюрьмы в хорошо укрепленную крепость. Их цели пока неизвестны. Руководителем группировки стал бывший генерал вооруженных сил США, что сделало ее крайне опасной. Молодой капитан был выбран среди лучших в корпусе морской пехоты США для обезвреживания опорных точек террористов, перед тем как по Алькатразу будет нанесен огневой удар.