В Anima: The Nameless Chronicles мы играем за Безымянного — бессмертного типа, который обречён бродить по миру до скончания времён. Просто его ещё давно прокляли, и теперь он не может умереть. А история начинается с того, что из прошлого Безымянного всплывает какая-то тень, и ему приходится ввязаться в конфликт, где решается судьба всего сущего. Также по ходу игры выясняется, что кто-то пытается воскресить древнее зло по имени Баал, и наш герой должен это предотвратить.