Действие "Боевого клона" разворачивается на Земле, чей космический флот полностью уничтожен боевыми кораблями враждебно настроенных инопланетян. Последней надеждой человечества стало новое изобретение ученых - сверхскоростной истребитель-трансформер. Он умеет трансформироваться в любую боевую единицу противника, копируя ее способности и характеристики. Вы управляете новым чудом техники, разбивая ряды противника и спасая будущее планеты.