Phantom Hourglass - продолжение части The Legend of Zelda: The Wind Waker. Подругу Линка Тетру похищает таинственный корабль-призрак. В попытках спасти ее он соскальзывает за борт, а приходит в себя на берегу Сиелы. Линк обращается за помощью к капитану Linebeck, вместе с которым на его корабле они пускаются на поиски Тетры. Герои плавают от острова к острову, на некоторых из которых исследуют пещеры и подземелья.
В первый месяц выхода в Японии игра стала настоящим бестселлером.